2007年9月3日

以ImageJ分析影片中面積的變化量

假設你有個培養皿,上面養了某種會變大的生物,你想知道在這個生物隨著時間變化的面積變化量。這樣的分析,ImageJ 也能做!

首先當然要想辦法處理出簡單化的影像。
以下方這個影片檔當作範例吧!這個影片檔其實是蝙蝠耳蝸的圖,不過就假裝當作是培養皿裡會變大變小的生物吧!
File-->Open Samples-->Bat Cochlea Volume


首先也是要用Threshold設定範圍
Image-->Adjust-->Threshold
調整的目標是每一影格的物體都變成紅色,其他背景不能有紅色


然後就進行分析
Analyze-->Analyze Particle



然後選擇Yes


很簡單的,數據就出來了,在第一個影格中只有一團生物,面積是7單位,到第六影格變成2團生物,面積變為478單位。如果想要有實際的單位,只要在進行這步處理之前,先設定scale即可。

這些產生的數據,都可以另外送到試算表中(Excel或oocal)去處理。


另外還會有輪廓描出的動態檔產生