喬了幾個時間，終於找到我有空，機器也有空的時間。然後去掃描了幾個部位，分別是腦、心和髖部。
自己想去做斷層掃描，其實不只是為了醫療，心裡頭更想要做的是看能不能做成3D模型，印一個自己的器官。不過該怎麼處理醫學影像呢？我沒這方面的經驗，所以開始在網路上尋找能處理的軟體。
結果意外的發現，原來imagej就可以開啟那些DICOM檔，然後直接做成3D影像了。不過要再安裝3D Viewer這個plugin。把那些掃描出來的DICOM檔，用File/Import/Image sequence..的方式把那些檔案匯入imagej變成一個stack，然後再開啟3D Viewer，就可以變成3D影像了。
例如心臟和下面的腦都是這樣開的。
也許你有注意到，開啟的軟體並不是單純的叫做Imagej，而是叫做「(Fiji Is Just) Imagej」的軟體，誠如軟體的名字所言，Fiji其實就是imagej，它是把許多生命科學研究相關的plugin預裝好的imagej。裡頭眾多的Plugin，我還沒細看過，但粗略看過的結果，發現一些plugin，可能可以解決過去我的一些分析問題。
imagej的3D Viewer，可以設定看Volume還是Surface，若要匯出成STL檔，則是要選擇檢視surface才可以。不過我發現光是靠Imagej處理表面的多邊形細節來輸出，實在不夠力，所以我繼續尋找可以使用的軟體。
Devide
後來在Youtube上找到這段影片《Extracting STL surface from CT data with DeVIDE》，完全符合我的需求，我只要跟著做就可以了。
使用的軟體有二，一個是Devide，另一個是Meshlab。在Devide裡頭使用的模組包括以下這些：
- slice3dVWR
- DICOMRreader
- doubleThreshold
- seedConnect
- closing
- contour
- wsMeshSmooth
- Quickinfo
Meshlab在網路有些教學，例如這篇就教了怎麼減少表面多邊形，不過像我在Devide就已經用wsMeshSmooth處理過了，所以也不一定要進去Meshlab來處理。
做出來的STL檔案，看來還不錯，不過還沒辦法去做成3D模型，因為我還沒搞懂怎麼把內部的細節填滿，還有頂和底的洞到底要怎麼封閉。那些問題搞定之後，才可以送到切片軟體去轉Gcode。
前面用的Devide，門檻有點高，我做了幾次都還是得邊看影片才會邊操作，所以我又在 Youtube找相關的操作影片，又找到一個軟體，名字叫做Invesalius。Invesalius的界面簡單，功能也很強，可以直接用預設值做出骨骼、脂肪、皮膚或肌肉等遮罩。不用多作設定，就可以將原先的橫切圖，直接產生出另外兩個方向的切面。
有中文界面，產出的3D圖，甚至可以把皮膚、肌肉和骨骼設定不同的透明度，然後同時呈現。有興趣看看這個用豬頭做3D模型的影片，就知道它的長處了。
